中國科學院南京分院是中國科學院的派出機構，聯(lián)絡和協(xié)調中國科學院駐江蘇、江西兩省的研究所，協(xié)助做好各單位領導干部隊伍建設，指導黨建、紀檢等工作，負責中國科學院與江蘇、江西兩省的院地合作，牽頭承辦中國科學院大學南京學院，聯(lián)絡與服務在江蘇省的中科院院士。1950年中國科學院接管原中央研究院在南京的科研單位，成立中國科學院華東辦事處。1978年11月，經國務院批準建立中國科學院南京分院。??

　　南京分院系統(tǒng)現有10家法人研究機構，其中空間天文領域有紫金山天文臺、南京天文光學技術研究所、南京天文儀器有限公司；資源環(huán)境領域有南京地質古生物研究所、南京土壤研究所、南京地理與湖泊研究所；高技術領域有蘇州納米技術與納米仿生研究所、蘇州生物醫(yī)學工程技術研究所、贛江創(chuàng)新研究院；江蘇省中國科學院植物研究所為省院共管單位。??

　??截止2023年12月，南京分院共有在職職工2845人，其中科技人員1877人，包括“兩院”院士8人，研究員及正高級工程技術人員485人，副研究員及高級工程技術人員802人；國家杰出青年科學基金獲得者43人，其他國家級各類高層次人才計劃入選者百余人，江蘇省第六期333工程入選者82人。?

????南京分院系統(tǒng)設有碩士學位授予點39個、博士學位授予點26個；2023年共有在讀研究生3819名（含在讀研究生和聯(lián)合培養(yǎng)研究生）、在站博士后390名。

　　近年來，南京分院強化國家戰(zhàn)略科技力量主力軍的使命擔當，不斷加強原始創(chuàng)新和關鍵核心技術攻關，推動科技創(chuàng)新高質量發(fā)展，系統(tǒng)各研究所在地學、空間天文、納米技術、生物醫(yī)學工程等優(yōu)勢學科領域產出了一批重大原始創(chuàng)新成果。同時，在院省市共同支持下，南京分院深化落實《中國科學院 江蘇省人民政府共建南京麒麟科技城推動南京綜合性科學中心建設打造南京區(qū)域創(chuàng)新高地合作協(xié)議》，全力推進國科大南京學院建設，以國家戰(zhàn)略需求為導向、以重大科技設施與平臺集群建設為牽引，積極拓展新一代信息技術、未來能源、生物安全等領域方向，加速建設空間集聚、學科集群的中科院南京麒麟區(qū)域創(chuàng)新高地。?

　　面對新形勢、新要求、新征程，南京分院將深入貫徹黨中央、國務院、院黨組各項指示精神，對標對表習近平總書記對中科院提出的“四個率先”和“兩加快一努力”要求，當好“國家隊”“國家人”，扛起“國家事”“國家責”，充分發(fā)揮科教深度融合、院地協(xié)同創(chuàng)新優(yōu)勢，努力成為科技、教育、人才協(xié)同推進先行示范基地，為我國科技強國建設做出應有的貢獻。?